1、Fragment AnalyzerTM全自動毛細(xì)管電泳系統(tǒng)應(yīng)用背景及優(yōu)勢
傳統(tǒng)瓊脂糖凝膠電泳由于其簡單、重復(fù)性好、操作簡單和易清洗，一直以來受到廣大實(shí)驗(yàn)室的普遍青睞，但事實(shí)上傳統(tǒng)凝膠方法無法分析長度小于50bp的DNA片段。由美國AATI公司生產(chǎn)推出的新一代Fragment AnalyzerTM全自動毛細(xì)管電泳系統(tǒng)，可以用于分析任意種類的dsDNA片段，包括普通PCR產(chǎn)物，多重PCR產(chǎn)物以及限制性酶切產(chǎn)物，微衛(wèi)星序列SSR等。Fragment AnalyzerTM系統(tǒng)分離片段具有以下優(yōu)勢：分辨率更高（分辨率高達(dá)2bp）；精確度更高（片段長度分析誤差≤5%）；分析通量高，可一次分析高達(dá)288個樣品；分析時間減少，PCR產(chǎn)物可直接上樣，無需進(jìn)行預(yù)處理。
2、Fragment AnalyzerTM系統(tǒng)SSR分析優(yōu)勢
全自動 分離膠和樣品自動上樣，無需手動灌膠，避免交叉污染
高通量 可一次檢測12或96個樣品，最多為288個樣品
高分辨 分辨率為2bp
高靈敏 檢測最低濃度可達(dá)5pg/ul
運(yùn)行快 15min內(nèi)完成700bp片段分離
成本低 無需芯片，毛細(xì)管可反復(fù)利用
易操作 PROSize2.0軟件直觀顯示分析結(jié)果
用途廣 可分析片段范圍為35-40000bp
更靈活 可提供12和96兩種型號的毛細(xì)管列陣
3、Fragment AnalyzerTM12或96的技術(shù)參數(shù)
1.主要用途：
1.1 用于高通量動植物基因組核酸擴(kuò)增產(chǎn)物微衛(wèi)星片段大小分析，即SSR分析。
1.2 用于農(nóng)業(yè)育種反向遺傳學(xué)輻射或化學(xué)誘變突變體篩查，即Tilling分析。
1.3 用于常規(guī)DNA/RNA或擴(kuò)增產(chǎn)物片段大小定性定量分析。
1.4 用于二代測序（NGS）過程中基因組DNA及文庫的質(zhì)控（定性定量）。
1.5 RNA定性定量分析。
1.6 質(zhì)粒DNA分析、CAPS/RAPD/AFLP分析。
1.7 同時具備定性和定量的功能。
2.工作條件
2.1 環(huán)境溫度: 15到25℃
2.2 電源：100-240 VAC, 50-60Hz
2.3 濕度：小于80%
3.技術(shù)指標(biāo)
3.1 自動進(jìn)樣系統(tǒng)標(biāo)準(zhǔn)要求：標(biāo)準(zhǔn)SBS格式96孔板裝載樣品，12或96個樣品同時進(jìn)樣，同時檢測。
3.2 進(jìn)樣系統(tǒng)配置要求：3x 96樣品進(jìn)樣托盤，可實(shí)現(xiàn)無人值守下288個樣本連續(xù)進(jìn)樣定性分析或384個樣本連續(xù)進(jìn)樣定量分析。
3.3 毛細(xì)管電泳分離技術(shù)，96通道毛細(xì)管長度55cm或者80cm。片段大小分辨率2bp(小于300bp片段)
3.4 全自動儀器，每次標(biāo)本分析都更換新的分離膠。
3.5 分析前全自動灌膠。
3.6 全自動進(jìn)樣。
3.7 全自動進(jìn)Marker和Ladder。
3.8 分析結(jié)束后全自動清洗毛細(xì)管。
3.9 分析結(jié)束后全自動將毛細(xì)管置入毛細(xì)管保存液中。
3.10 標(biāo)準(zhǔn)分析時間：15分鐘內(nèi)完成96個樣本的分析檢測（小于3kbp樣本）
3.11 檢出限：5 pg/μL，即2ul上述單組分標(biāo)本稀釋12倍后進(jìn)樣，可測出信噪比大于10：1的信號。
3.12 動態(tài)范圍：從最小至最高優(yōu)于3個數(shù)量級。
3.13 樣品要求：PCR產(chǎn)物、基因組DNA、RNA等。樣品無需純化除鹽等后處理，直接進(jìn)樣分析。
3.14 可檢測DNA范圍：35～100000bp。最大可測到10萬堿基對，可對gDNA基因組DNA進(jìn)行質(zhì)控檢測。
3.15 突變檢測靈敏度：可檢測1000bp大小的DNA片段中1個堿基突變的存在以及8個混合樣本中1個突變樣本的存在。
3.16 適用的試劑盒：基因組DNA，NGS，RNA及常規(guī)片段大小分離試劑盒。
3.17 片段大小計算精度：優(yōu)于5%,
3.18 光源：長壽命LED光源（標(biāo)準(zhǔn)壽命超過10年）激發(fā)波長470nm。
3.19 檢測器：高靈敏度CCD檢測器，檢測樣本的發(fā)射波長范圍：500～600nm。
3.20 具備電壓進(jìn)樣和真空進(jìn)樣2種進(jìn)樣方式。
3.21 可同時放入2種不同類型的分離膠，2種不同類型的應(yīng)用可不需要人工干預(yù)連續(xù)進(jìn)行，如可連續(xù)進(jìn)行DNA和RNA定性定量分析。
