1、Fragment AnalyzerTM全自動毛細管電泳系統應用背景及優勢

傳統瓊脂糖凝膠電泳由于其簡單、重復性好、操作簡單和易清洗，一直以來受到廣大實驗室的普遍青睞，但事實上傳統凝膠方法無法分析長度小于50bp的DNA片段。由美國AATI公司生產推出的新一代Fragment AnalyzerTM全自動毛細管電泳系統，可以用于分析任意種類的dsDNA片段，包括普通PCR產物，多重PCR產物以及限制性酶切產物，微衛星序列SSR等。Fragment AnalyzerTM系統分離片段具有以下優勢：分辨率更高（分辨率高達2bp）；精確度更高（片段長度分析誤差≤5%）；分析通量高，可一次分析高達288個樣品；分析時間減少，PCR產物可直接上樣，無需進行預處理。

2、Fragment AnalyzerTM系統SSR分析優勢

• 全自動  分離膠和樣品自動上樣，無需手動灌膠，避免交叉污染

• 高通量  可一次檢測12或96個樣品，最多為288個樣品

• 高分辨  分辨率為2bp

• 高靈敏  檢測最低濃度可達5pg/ul

• 運行快  15min內完成700bp片段分離

• 成本低  無需芯片，毛細管可反復利用

• 易操作 PROSize2.0軟件直觀顯示分析結果

• 用途廣  可分析片段范圍為35-40000bp

• 更靈活  可提供12和96兩種型號的毛細管列陣  

3、Fragment AnalyzerTM12或96的技術參數

1.主要用途：

1.1   用于高通量動植物基因組核酸擴增產物微衛星片段大小分析，即SSR分析。 

1.2   用于農業育種反向遺傳學輻射或化學誘變突變體篩查，即Tilling分析。

1.3   用于常規DNA/RNA或擴增產物片段大小定性定量分析。

1.4   用于二代測序（NGS）過程中基因組DNA及文庫的質控（定性定量）。

1.5   RNA定性定量分析。 

1.6   質粒DNA分析、CAPS/RAPD/AFLP分析。

1.7   同時具備定性和定量的功能。

2.工作條件

2.1   環境溫度: 15到25℃

2.2   電源：100-240 VAC, 50-60Hz 

2.3   濕度：小于80%

3.技術指標

3.1   自動進樣系統標準要求：標準SBS格式96孔板裝載樣品，12或96個樣品同時進樣，同時檢測。

3.2   進樣系統配置要求：3x 96樣品進樣托盤，可實現無人值守下288個樣本連續進樣定性分析或384個樣本連續進樣定量分析。

3.3   毛細管電泳分離技術，96通道毛細管長度55cm或者80cm。片段大小分辨率2bp(小于300bp片段) 

3.4   全自動儀器，每次標本分析都更換新的分離膠。

3.5   分析前全自動灌膠。

3.6   全自動進樣。

3.7   全自動進Marker和Ladder。

3.8   分析結束后全自動清洗毛細管。

3.9   分析結束后全自動將毛細管置入毛細管保存液中。

3.10    標準分析時間：15分鐘內完成96個樣本的分析檢測（小于3kbp樣本）

3.11    檢出限：5 pg/μL，即2ul上述單組分標本稀釋12倍后進樣，可測出信噪比大于10：1的信號。 

3.12    動態范圍：從最小至最高優于3個數量級。

3.13    樣品要求：PCR產物、基因組DNA、RNA等。樣品無需純化除鹽等后處理，直接進樣分析。

3.14    可檢測DNA范圍：35～100000bp。最大可測到10萬堿基對，可對gDNA基因組DNA進行質控檢測。

3.15    突變檢測靈敏度：可檢測1000bp大小的DNA片段中1個堿基突變的存在以及8個混合樣本中1個突變樣本的存在。

3.16    適用的試劑盒：基因組DNA，NGS，RNA及常規片段大小分離試劑盒。

3.17    片段大小計算精度：優于5%, 

3.18    光源：長壽命LED光源（標準壽命超過10年）激發波長470nm。

3.19    檢測器：高靈敏度CCD檢測器，檢測樣本的發射波長范圍：500～600nm。

3.20    具備電壓進樣和真空進樣2種進樣方式。

3.21    可同時放入2種不同類型的分離膠，2種不同類型的應用可不需要人工干預連續進行，如可連續進行DNA和RNA定性定量分析。